南京中医药大学始建于1954年，是全国建校最早的高等中医药院校之一，是江苏省人民政府与国家中医药管理局共建单位。建校初期，南京中医药大学为新中国高等中医教育培养输送了第一批师资、主持编写了第一套教材和教学大纲，培养并诞生了新中国中医药界最早的学部委员（院士），为新中国现代中医高等教育模式的确立和推广做出了重要贡献，被誉为“中国高等中医教育的摇篮”。目前，南京中医药大学是世界卫生组织（WHO）传统医学合作中心、国家卫生部确定的国际针灸培训中心、全国中医师资进修教育基地、中国中医文献检索中心分中心，同时也是首批获国家教育部批准接受和培养外国留学生及台港澳地区学生的高等中医药院校。

学校现有教育部工程研究中心1个、省部共建针药结合重点实验室1个、国家中医药管理局重点研究室2个、江苏省重点研究机构2个、省级工程研究中心3个、江苏省科技厅重点实验室2个、江苏省教育厅重点实验室3个、南京市工程技术研究中心2个。学校构建形成了“一个中心、四大板块”的科技平台布局，即江苏省中医药研究与新药创制中心和南京中医药大学科技园、南京高新技术开发区中药产业园区、中国医药城中医药研究院、江苏生命科技创新园，加快推进“产、学、研”结合，积极为地方经济社会发展服务。

南京中医药大学积极参与国家、江苏省和南京市科技创新体系建设，推动技术转移对接活动，开展中医药技术转移的组织与服务工作以及技术转移项目过程管理，探索符合社会主义市场经济要求，适应高等中医药院校的技术转移特点的技术转移运行机制和管理模式。
    构建一个中医药产品开发特色的产学研支撑服务体系。加强与省内制药企业进行多方面合作，解决企业在生产中关键技术难题，推动中药新药校企联合技术攻关；与附属医院建立科技协作网络体系，在企业科技创新基金项目联合申报、医院制剂研发、基于临床经验方的新药合作开发等方面展开全面合作。
    组建一个校地产学研合作和技术转移辐射支撑体系。构建我校科技中心与泰州医药城、南京浦口生物医药研发基地、江苏生命科技创新园、南京市鼓楼大学科技园的校地科技辐射支撑体系，构建我校中医药技术转移网络体系。
    因地制宜建设一支精干适用的技术转移工作队伍。组织专家队伍赴南京新城科技园、正大天晴药业集团股份有限公司、泰州高港区等地参加产学研合作，分析市场，掌握信息，解决企业技术难题。